מאז שקוזי זוכר את עצמו הוא חי במרומי הרי האנדים, חבוי ומוסתר מעיני העולם כשלצידו רק צ'וטו הזקן, רועה הלאמות. קוזי וצ'וטו, בנים לשבט האינקה העתיק, חיים את חיי המרעה השלווים בין הצוקים הפראיים ומקווי המים הצלולים. אך חייו של קוזי אינם שלווים כלל וכלל. שאלות רבות מטרידות אותו: מאין בא? מי היו הוריו ומדוע אין לו משפחה ? שאלות אלה מביאות אותו לצאת למסע גורלי, מסע אל העמק שבמורדות ההרים, מסע אל עולמם של בני האדם. האם ימצא את מבוקשו? או אולי יבין את משמעות הפתגם האינדיאני העתיק: "אל תצטער אם חיפושיך סובבים במעגל"?
סוד האנדים הוא סיפור עלילה פיוטי ושיר הלל לגדולתה של ממלכת האינקה בימי קדם, לפני בוא האדם הלבן ובתקופה שבה רק ההרים הפראיים היו שותפים לגורלה. זה סיפורם של בני השבט ששרדו ומבקשים גם היום לשמור על כבודם ולזכור את ימי תהילתם.
אן נולן קלארק (1995 - 1898) נולדה בארצות הברית וחיה שנים רבות באמריקה הדרומית, שם לימדה בכפרים של צאצאי האינדיאנים. כך זכתה, לדבריה, בהשראה לכתיבת ספריה.
"מעמק נסתר בין פסגות ההרים בפרו מגיע הסיפור העדין הזה והנדיר ביופיו." הורן בוק, כתב עת לספרות ילדים.